Lite tips från mig:
Många gömställen - både högt och lågt där kan ha uppsikt över rummet de ligger i. Jag skulle börja med att introducera dem för bara ett rum där man kunde stänga till och där de fick bo i några dagar, stora ytor blir lätt väldigt överväldigande och skrämmande för skygga katter och ökar risken för att de ska göra ifrån sig på fel ställen.
Lådan bör man ha på en undanskymd plats så katterna lätt kan smyga dit, ha även mat och vatten på (olika) undanskymda platser. Du kan också gärna ha två kattlådor så katterna alltid har nära till åtminstone en om de har hela bostaden att röra sig i.
Feromoner som lugnar stressade katter heter Feliway och kan bl.a. köpas på veterinärkliniker:
http://www.feliway.com/se
Jag tror inte det är någon fara om den gamla kattens saker ligger kvar.
När du ska socialisera dem senare så är lek ett väldigt hett tips, kattungar kan sällan motstå bus och det brukar få dem att tina upp lite om man leker med t.ex. en rolig leksak av en längre modell så att katten kan hålla en armslängds avstånd i början medan man sitter i soffan och tittar på annat (för mycket uppmärksamhet kan uppfattas som hotfullt).
Så småningom kan man stryka över deras ryggar mitt i leken då och då så att de vänjs vid beröring.
Förmodligen kommer en katt bli mindre skygg än den andra och då kan man umgås mycket med den för att visa den andra kattungen att det inte är någon fara.